Однажды вблизи города Марселя рыбаки вытаскивают из воды странного человека - Джейсона Борна (Мэтт Дэймон). Он ничего не помнит, но имеет две огнестрельные раны и зашитую в ноге секретную капсулу с номером счета в швейцарском банке. Получив в Цюрихе деньги, он узнает свое имя Джейсон Борн. Но что делать дальше? Как и положено в этих случаях, главный герой пытается узнать, кто он, за что ранили, и кто виноват.

Однажды на небе появляется двойник Земли, и в тот же вечер Рода Уильямс, студентка факультета астрономии, становится виновницей катастрофы, в которой почти целиком погибает молодая семья. Выживает только глава семейства Джон Бурро. Движимая чувством вины, Рода пытается связаться с Джоном, чтобы попросить прощения, но постоянно откладывает объяснения, боясь спугнуть зарождающееся чувство. В конце концов, она получает возможность оказаться на таинственной Земле-2, чтобы попытаться выяснить, как могла бы сложиться ее жизнь, и можно ли изменить прошлое.